L’armée américaine exécute un test d’émetteur radio de type particulier, permettant de communiquer avec les sous-marins, dans un réseau profond de grottes en Amérique centrale. Lorsque le signal d’un des émetteurs disparaît soudainement, une équipe de soldats menés par le Major Elbert Stevens (Bottoms) et de spécialistes en spéléologie dirigés par Rupert « Wolf » Wolfsen (Powell), ainsi qu'une scientifique Leslie Peterson (Blount) sont envoyés pour savoir ce qui s’est é.